生物工程是运用生物学、化学、工程学等基础学科的基本原理，并与机械、材料、医学等多学科相互交叉、渗透、融合而发展起来的新兴工程技术学科。我院2007年开始授权招生生物工程专业，一直以来本着培养具有时代精神、完善人格、创新意识，具备生物工程与技术产品及其产业化的科学原理、分析检测手段，掌握工艺技术过程和工程设计等基本理论和基本知识，具备熟练的科学实验操作技能和坚实的工程设计能力，能在生物技术与工程领域方面从事产业化工程设计、生产及行政管理和新技术研究、新产品开发工作的有较强实践和创新能力的高素质应用型人才，授予工学学士学位。
我院生物工程专业历经几年的建设和发展，师资力量雄厚，专业设施较为完善。目前。本专业有高级职称18人，其中教授6人，副教授12人，同时具有博士学位的16人，全体教师致力于教学和教学改革，成绩显著；专业设有发酵工程、基因工程、细胞工程、蛋白质工程等专业实验室，大型仪器设备百余台，教学配套设施齐全。
生物工程专业在多年的发展过程中，与国内多家大中型企业和兄弟院校建立了良好的合作与交流关系，为学生实践教学和就业提供了良好的环境。
就业去向：该专业培养掌握生命科学和工程科学的复合型人才，学生毕业后可以进一步攻读硕士学位学习深造；或到制药、食品、环境和轻工等生物工程相关的高新技术企业从事生产技术管理、新技术研究和新产品开发；也可以到生物工程院校、医院、科研机构及有关工程部门从事研究、开发和管理工作。随着生物工程企业近年的快速发展趋势，毕业生需求量大，就业状况乐观。
课程设置
课堂教学环节包括生物化学、微生物学、化工原理、发酵工程、蛋白质工程、细胞工程、基因工程、生物工程大实验、生物分离工程、工程制图、生物制药工艺学、生化工程设备等；实践教学环节包括动植物实习、生态实习、发酵及制药企业生产实习和毕业设计等。
学分设置
| 课程类别 | 学分数 | 占总学分% | |
| 通识教育课程 | 通修课程 | 44 | 27.41 |
| 通选课程 | 8 | 4.98 | |
| 专业教育课程 | 专修课 | 64.5 | 40.19 |
| 专选课程（专业系列选修课） | 28 | 17.45 | |
| 任意选修课程 | 16 | 9.97 | |
| 合计 | 160.5 | 100 | |
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