理学院前身是1934年国立西北农林专科学校成立时的数学、化学、物理教学组。历经七十多年的教学改革和发展，先后组建成立了基础课部、基础科学系和生命科学学院。为进一步适应社会经济发展和学科建设的需要，2006年6月成立了理学院。
学院现有职工196人，其中专职教师159人，教授26人，副教授40人;博士生导师17人，硕士生导师34人。双聘院士1名，“教育部新世纪优秀人才支持计划”入选者 6人，“高等学校优秀青年教师资助计划”入选者 1人，陕西省教学名师 2人 ， 后稷学者特聘教授1人，陕西省“百人计划”人选者2人，校拔尖人才 2人，校青年学术骨干3人。
学院现有应用数学、应用化学和应用物理3个系，生物物理学和化学生物学2个博士学位授权点，生物物理学、化学生物学、应用化学和应用数学4个硕士学位授权 点，应用化学和信息与计算科学2个本科专业。在校学生817名，其中博士研究生31名，硕士研究生206人，本科生580人。
拥有陕西省高等学校化学实验教学示范中心1个，校级教学实验中心2个，52个各类教学科研实验室；设有陕西省资源化学与可持续利用工程研究中心、天然药物化学研究中心、生物数学研究所、生物物理研究所等4个研究机构。学院既承担本院各专业课程的教学，还承担全校本科生和研究生的数学、化学、物理和气象等40余门基础课程的理论教学和实验教学任务，是学校重点建设的学院之一。
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