第二临床医学院设在广东医学院东莞校区，学院开设临床医学和口腔医学两个专业，临床医学专业是“全国高等学校特色专业建设点”和“广东省名牌专业”。临床医学专业是一级学科硕士点，面向全国招收硕士研究生。在校本科生3000多人，学生就业形势良好,近三年就业率均在95%以上，大部分毕业生在珠三角地区就业。近两年学生考研通过率达50%，部分学生被北京大学、复旦大学等著名大学录取。
学院利用珠三角地区丰富的医疗资源，经过多年的建设和发展，已成为专业成熟，学科齐全，师资力量雄厚，教学管理规范的二级学院。现有专任教师（含非直属附属医院）350人，副高及以上职称128人，具有博士、硕士学位的教师229人，占65.4%。拥有100多家临床教学基地。
学院设有规模大、设备齐全、特色明显的临床技能培训中心和模拟医院，是广东省教学示范中心，为学生临床技能训练提供了条件保证。我院学生获得2012年第三届全国高等医学院校大学生临床技能竞赛华南赛区三等奖。
正在兴建的附属松山湖医院占地357亩，建筑面积282800平方米，床位1000张，医院门诊已于2011年12月28日开业，将逐步发展成为一所功能完善、设备先进、技术精湛、管理规范、环境优美的三级综合性教学医院。医院建成后将成为学院的主要临床实践基地。
学院秉承“立志立德、求真求精”的校训，弘扬“医德与医术相长，人文与科学并重”的专业理念，实施“卓越医生”培养计划，坚持“临床实践能力培养5年不断线，人文素质培养5年不断线”的培养特色，努力培养基础知识扎实、临床实践能力强、人文素养高、具有创新意识的应用型医学人才。
临床医学
五年制 国家级特色专业建设点 广东省高校重点专业 广东省应用型人才示范专业 广东省高校名牌专业 招收理科
授予本科毕业证书、医学学士学位
培养目标：培养德、智、体全面发展的从事临床医疗工作的通科医学高级专业人才。要求学生掌握现代医学基础理论、基本知识和基本技能，能运用所学知识和技能诊治人类常见病、多发病，能基本处理疑难危重疾病，有一定的预防医学和中医学基本知识及具有临床医学初步科研能力。
主要专业课程：以基础医学、临床医学等为主干学科。主要课程有系统解剖学、组织胚胎学、生理学、生物化学与分子生物学、医学微生物学、医学免疫学、病理学、药理学、预防医学、传染病学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、神经病学、精神医学等。
就业方向：毕业生毕业后在各级综合性医院、专科医院、医学院校、疾病预防控制中心和卫生监督所、医学科研部门和其他医药相关等部门从事临床医疗、预防保健、医学教育和医学研究工作。
口腔医学
五年制 招收理科生
授予本科毕业证书、医学学士学位
培养目标：培养德、智、体全面发展的从事口腔医疗和保健工作的医学高级专业人才。要求学生掌握基础医学、临床医学和口腔医学的基本理论和基本技能，具有对口腔常见病、多发病的诊治处理能力，具有口腔修复工作的基本知识和一般操作技能。具有临床医学初步科研能力，成为具有基础宽厚扎实、实践能力强，富有创新精神和良好职业素养的口腔医学专门人才。
主要专业课程：以基础医学、临床医学和口腔医学为主干学科。主要课程有系统解剖学、组织胚胎学、生物化学与分子生物学、病理学、药理学、诊断学、内科学、外科学、儿科学、口腔解剖生理学、口腔组织病理学、口腔内科学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔正畸学等。
就业方向：毕业生毕业后在医学院校、医院、科研部门和其他医药相关行业从事口腔临床医疗、预防保健、医学教育和医学研究等工作。
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