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学院现有生物学、食品科学与工程、生物医学工程3个一级学科硕士点和1个发酵工程二级学科硕士点，以及生物工程和食品工程2个工程硕士专业学位授权点；拥有生物学、食品科学与工程2个省级重点学科；生物医药工程技术实验中心和食品科学工程中心实验室2个省部共建高校特色优势学科实验室；1个省级实验教学示范中心和1个省级人才培养模式创新实验区；食品科学与工程专业为教育部“卓越工程师教育培养计划”实施专业、福建省特色专业。学院与美国加州大学戴维斯分校签订了海外学习项目；设有创新研究型拔尖人才培养实验班。
生物工程类（包括生物工程、生物技术两个专业）
生物工程专业
本专业主要培养具备生物学与工程学方面基本知识以及自然科学和人文科学基础知识，能在生物技术与工程等相关领域从事生物工程产品生产、工艺设计、生产管理、新技术研究和新产品开发的学科交叉应用型人才。毕业后可在生物工程、生命科学、生物制药、食品、化工、环保、商检、卫生防疫等行业，从事科学研究、工艺设计、技术管理、产品研发、生化分析检测等工作。
生物技术专业
本专业旨在培养具备较强的数理化基础，具有国际化视野，接受严格科学思维、专业理论和专业技能的训练，系统地掌握生物科学与技术的基础理论、基本知识和基本技能，具有生物技术理论联系实际、独立思考、勇于创新的科学精神，能适合生物技术及相关学科的理论及应用性研究的科研创新能力强、综合素质全面的复合型人才。毕业后学生可胜任制药、食品、能源、化工、环保、材料、商检、疾病防控等生物技术及其相关领域的科学研究、技术开发、检测及管理等工作。
食品科学与工程专业
本专业为教育部“卓越工程师教育培养计划”实施专业、福建省特色专业。主要培养食品科学与工程、食品分析与检测等领域的专门人才，要求学生掌握扎实的科学理论、工程技术和实践经验，具有良好的外语和计算机应用能力，系统掌握食品科学与工程领域的基本知识和基本技能。学生毕业后能从事食品企业、教育、卫生监督和食品安全管理等相关部门的教育教学、科研、技术开发、生产管理、检验检疫、产品销售等工作。
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