茶与食品科技学院设有茶业系、食品工程系。下设茶学、茶文化与贸易、食品科学与工程、食品质量与安全和食品卫生与营养学等5个本科专业；拥有园艺学博士后流动站1个，茶学二级学科博士授权点1个、食品科学与工程一级学科硕士授权点1个，茶学、食品科学、农产品加工与贮藏、营养与食品卫生学和粮油、油脂及植物蛋白工程、食品加工与安全（专硕）二级学科硕士授权点6个。
茶学为国家重点培育学科、农业部和安徽省重点学科，茶学专业为国家级特色专业，是安徽省首批设立特聘教授岗位的学科，建有中华茶文化研究所。所属茶叶生物化学与生物技术实验室为国家重点实验室培育基地及教育部和安徽省重点实验室，同时为农业部茶树生物学与茶叶加工重点实验室。
食品学科的食品科学与工程专业为安徽省特色专业。建有安徽省农产品加工工程实验室，合肥市农产品加工研究院。与安徽省出入境检验检疫局共建食品安全分析与检测省级重点实验室。
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